เมื่อช่วงบ่ายของวันที่ 13 กรกฎาคม 2561 ได้มีพิธีการจับสลากประกบคู่ฟุตบอล ช้าง เอฟเอคัพ 2018 รอบ 16 ทีมสุดท้ายโดยพิธีจับสลากจัดขึ้นที่ ห้องราชาวดี ราชพฤกษ์คลับ ถนนวิภาวดี
ช้าง เอฟเอคัพ 2018 เดินทางมาถึงรอบ 16 ทีมสุดท้าย โดยทีมที่สามารถผ่านเข้ารอบมาได้จากการลงเล่นรอบ 32 ทีม เมื่อวันที่ 4 กรกฎาคม ที่ผ่านมา ประกอบด้วยทีมจากศึก โตโยต้า ไทยลีก จำนวน 8 ทีม ทีมจากศึกเอ็ม-150 แชมเปี้ยนชิพ จำนวน 4 ทีม และทีมจากศึกออมสิน ลีกโปร จำนวน 1 ทีม ทีมจากศึกออมสิน ลีก อีกจำนวน 3 ทีม และรอบ 16 ทีมสุดท้าย จะทำการแข่งขันกันในวันพุธที่ 25 กรกฎาคมนี้
ผลการจับสลากประกบคู่รอบ 16 ทีมสุดท้าย
ราชนาวี – ศรีสะเกษ เอฟซี
นรา ยูไนเต็ด – บีจีซี เอฟซี
นครปฐม ยูไนเต็ด – บุรีรัมย์ ยูไนเต็ด
ขอนแก่น เอฟซี – บ้านค่าย ยูไนเต็ด
สิงห์ เชียงราย ยูไนเต็ด – เอสซีจี เมืองทอง ยูไนเต็ด
ตราด เอฟซี – การท่าเรือ เอฟซี
ราชบุรี มิตรผล เอฟซี – กระบี่ เอฟซี
ชลบุรี เอฟซี – โปลิศ เทโร เอฟซี
สำหรับการแข่งขันในรอบ 16 ทีมสุดท้ายเป็นการแข่งขันแบบน็อคเอาท์ จนถึงเกมนัดชิงชนะเลิศ และทีมที่สามารถคว้าแชมป์ได้ จะได้สิทธิ์ไปเล่นรอบเพลย์ออฟ ของฟุตบอล เอเอฟซี แชมเปี้ยนส์ลีก 2019